生物技术系的学科建设紧密围绕现代都市农业发展的需要，充分发挥用现代生物技术改造传统农业的优势，解决农业、食品安全、环境保护中的实际问题。目前在建学科有植物学、细胞生物学和生态学。学科研究方向为植物抗逆的分子生物学、植物抗逆的生理生态、植物资源与利用、细胞信号传导、细胞分子生物学、细胞发育与细胞工程、生态安全。