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新疆医科大学2021在全国本科院校排名第329位，强于第330名的浙江科技学院，第331名的上海对外经贸大学，第332名的厦门理工学院，第333名的大连交通大学，第334名的四川美术学院。在新疆排第3名，强于第4名的新疆师范大学，第5名的新疆农业大学，第6名的新疆财经大学，第7名的塔里木大学，第8名的喀什大学。

竞争力排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2021 329 新疆医科大学 新疆 3 2020 332 新疆医科大学 新疆 3 2019 331 新疆医科大学 新疆 4 2018 301 新疆医科大学 新疆 3 2017 237 新疆医科大学 新疆 3

综合实力排名（校友会版）

在全国本科院校排名第240位，在新疆排第4名。

校友会排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2020 240 新疆医科大学 新疆 4 2019 259 新疆医科大学 新疆 4 2018 254 新疆医科大学 新疆 3 2017 244 新疆医科大学 新疆 4

综合实力排名（软科版）

在全国本科院校排名第258位，在新疆排第1名。

软科排名 年份 全国本科排名 院校名称 省份 省内排名 2018 258 新疆医科大学 新疆 1 2017 432 新疆医科大学 新疆 3